O Departamento de Biologia Vegetal (DBV) tem por missão o ensino, a investigação e a transferência de conhecimento e inovação na área científica da Biologia. Esta missão tem duas componentes principais. Por um lado, oferecer formação de nivel superior, ao nível da graduação (1º ciclo) e pós-graduação (2º e 3º ciclos), organizando cursos conferentes dos graus académicos correspondentes.

Simultâneamente, o DBV articula-se com unidades de Investigação e Desenvolvimento (I&D) que exercem actividades nas suas instalações sob gestão da Faculdade, da Universidade, ou de instituições por elas participadas. 

Historicamente, as áreas científicas da Biologia em que o DBV tem desempenhado a sua missão são a Genética, a Biologia Celular e Molecular, a Biotecnologia Vegetal, a Biologia e Biotecnologia Microbianas, e a Fisiologia e Ecologia Vegetais, abrangendo quer sistemas terrestres quer marinhos.  

Os docentes e investigadores do DBV têm-se distribuido de forma em geral equilibrada entre estes domínios, o mesmo se passando com o panorama de unidades curriculares oferecidas pelo departamento com vista à formação dos seus alunos.