A grande maioria dos membros do DQB desenvolvem a sua atividade de investigação no Centro de Química e Bioquímica (CQB 2002- ) e no Centro de Ciências Moleculares e Materiais (CCMM 1994- ), enquanto outros integram unidades como o BioFiG – Centro de Biodiversidade e Genómica Funcional e Integrativa (FCUL), o Centro de Química Estrutural (IST-UTL), o Grupo de Física Matemática (UL) , o Instituto de Tecnologia Química e Biológica (UNL) e o Centro de Química-Física Molecular (IST-UTL).